Yaiba is voorbestemd om een bekwame samoerai te worden en wijdt zich met lichaam en ziel aan intensieve training in het hart van de tropische jungle. Een speling van het lot dwong hem om samen met zijn vader naar Tokio te reizen, waar hij het pad kruiste van Takeshi Onimaru, een even vurige als ambitieuze vechter, die zijn vaste tegenstander werd. Helaas neemt hun confrontatie een tragische wending wanneer de laatste, door het voorouderlijke zwaard van zijn familie te grijpen, bezwijkt voor de invloed van een demonische kracht. Zo begint een gevaarlijk avontuur voor Yaiba, onderbroken door onverwachte ontmoetingen en titanengevechten.
